您好，感谢您的提问。您应该在北京办理签证。

日本驻北京大使馆可以受理护照签发地为北京市、天津市、陕西省、山西省、甘肃省、河南省、河北省、 湖北省、湖南省、青海省、新疆维吾尔自治区、宁夏回族自治区、西藏自治区、内蒙古自治区的因私护照持有人的签证申请。

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